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アイテム
A single nucleotide polymorphism genotyping method using phosphate-affinity polyacrylamide gel electrophoresis
https://hiroshima.repo.nii.ac.jp/records/2006205
https://hiroshima.repo.nii.ac.jp/records/200620531789cff-c0a4-4b81-98a2-b8166dbfe844
| 名前 / ファイル | ライセンス | アクション |
|---|---|---|
AnalBiochem_361_294.pdf (312.8 KB)
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| Item type | デフォルトアイテムタイプ_（フル）(1) | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 公開日 | 2023-03-18 | |||||||||||
| タイトル | ||||||||||||
| タイトル | A single nucleotide polymorphism genotyping method using phosphate-affinity polyacrylamide gel electrophoresis | |||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||
| 作成者 |
Kinoshita, Eiji
× Kinoshita, Eiji
× Kinoshita-Kikuta, Emiko
× Koike, Tohru
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| アクセス権 | ||||||||||||
| アクセス権 | open access | |||||||||||
| アクセス権URI | http://purl.org/coar/access_right/c_abf2 | |||||||||||
| 権利情報 | ||||||||||||
| 権利情報 | Copyright (c) 2007 Elsevier Ltd. | |||||||||||
| 主題 | ||||||||||||
| 主題Scheme | Other | |||||||||||
| 主題 | SNP genotyping | |||||||||||
| 主題 | ||||||||||||
| 主題Scheme | Other | |||||||||||
| 主題 | Allele-specific PCR | |||||||||||
| 主題 | ||||||||||||
| 主題Scheme | Other | |||||||||||
| 主題 | Phosphate-affinity PAGE | |||||||||||
| 主題 | ||||||||||||
| 主題Scheme | Other | |||||||||||
| 主題 | Zinc | |||||||||||
| 主題 | ||||||||||||
| 主題Scheme | NDC | |||||||||||
| 主題 | 460 | |||||||||||
| 内容記述 | ||||||||||||
| 内容記述 | To date, various methods have been developed to facilitate the genotyping of a single nucleotide polymorphism (SNP) for aiding in the diagnosis and treatment of inherited diseases. The most commonly used method for SNP genotyping is an allele-specific hybridization procedure using an expensive fluorochrome-labeled oligonucleotide probe and a specialized fluorescence analyzer. Here, we introduce a simple and reliable genotyping method using a 1:1 mixture of 5'-phosphate-labeled and non-labeled allele-specific PCR primers. The method is based on the difference in mobility of the phosphorylated and nonphosphorylated PCR products (in the same number of base pairs) on phosphate-affinity polyacrylamide gel electrophoresis. The phosphate-affinity site is a polyacrylamide-bound dinuclear zinc(II) complex, which preferentially captures the 5'-phosphate-labeled allele-specific product compared with the corresponding non-labeled product. The obtained DNA migration bands can be visualized by ethidium bromide staining. We demonstrate the genotyping of a SNP reported in a human cardiac sodium channel gene, SCN5A, using this novel procedure. | |||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||
| 出版者 | ||||||||||||
| 出版者 | Elsevier | |||||||||||
| 言語 | ||||||||||||
| 言語 | eng | |||||||||||
| 資源タイプ | ||||||||||||
| 資源タイプ識別子 | http://purl.org/coar/resource_type/c_6501 | |||||||||||
| 資源タイプ | journal article | |||||||||||
| 出版タイプ | ||||||||||||
| 出版タイプ | AO | |||||||||||
| 出版タイプResource | http://purl.org/coar/version/c_b1a7d7d4d402bcce | |||||||||||
| 関連情報 | ||||||||||||
| 識別子タイプ | DOI | |||||||||||
| 関連識別子 | 10.1016/j.ab.2006.11.032 | |||||||||||
| 関連情報 | ||||||||||||
| 識別子タイプ | PMID | |||||||||||
| 関連識別子 | 17196923 | |||||||||||
| 関連情報 | ||||||||||||
| 関連タイプ | isVersionOf | |||||||||||
| 識別子タイプ | DOI | |||||||||||
| 関連識別子 | http://dx.doi.org/10.1016/j.ab.2006.11.032 | |||||||||||
| 収録物識別子 | ||||||||||||
| 収録物識別子タイプ | ISSN | |||||||||||
| 収録物識別子 | 0003-2697 | |||||||||||
| 収録物識別子 | ||||||||||||
| 収録物識別子タイプ | NCID | |||||||||||
| 収録物識別子 | AA00524867 | |||||||||||
| 開始ページ | ||||||||||||
| 開始ページ | 294 | |||||||||||
| 書誌情報 |
Analytical Biochemistry Analytical Biochemistry 巻 361, 号 2, p. 294-298, 発行日 2007-02-15 |
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| 旧ID | 17037 | |||||||||||
